Фамилия Галпапупенко — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, звучит как мини-сюжет. Если разобрать её на части, сразу бросается в глаза необычная конструкция: Гал-па-пуп-енко. Суффикс -енко типичен для украинских фамилий и указывает на происхождение с территории современной Украины или юга России. Основа же — явно составная, что встречается нечасто.

Самый вероятный корень — «пуп». В славянской традиции это слово имело не только анатомическое значение. «Пупом» называли центр, середину чего-либо, а в прозвищах — человека плотного, круглого, возможно, невысокого. Вторая часть «гал-» могла произойти от диалектного «гала», что в южных говорах означало «шум, гам, галдёж». Человек мог получить прозвище Галпапуп — «шумный пузан» или «гам вокруг пуза», то есть либо за внешность, либо за манеру вести себя. Вставка «па» между корнями — типичный соединительный элемент, как в словах «пароход» или «водопад», но здесь она скрепляет два корня в одно прозвище.

Версия о связи с тюркскими или иными восточными корнями маловероятна: состав «гал-» встречается в тюркских языках («гал» — приходи, оставайся), но сочетание с «пуп» и украинский суффикс -енко делают эту гипотезу натянутой. Скорее всего, перед нами чисто славянская, шутливая или описательная фамилия, каких много на Украине: Голопузенко, Пузаненко, Кривоноженко.

Географически фамилия Галпапупенко могла закрепиться в Полтавской, Черниговской или Харьковской губерниях — там, где были распространены составные прозвища и суффикс -енко. Носители фамилии — потомки человека, которого в селе знали как Галпапупа: возможно, торговца на базаре, который шумно зазывал покупателей, или просто весёлого полного мужика. Сословно такие фамилии обычно принадлежали казакам или крестьянам, реже — мещанам.

Написание фамилии устойчиво: с двумя «п», слитно, с ударением, скорее всего, на последний слог — Галпапупе́нко. Встречаются ли известные люди с такой фамилией — данных нет, но её уникальность сама по себе делает её запоминающейся.