Фамилия Гаптельганиев — редкий случай, когда не нужно гадать, из каких корней она состоит: всё лежит на поверхности, если знать хотя бы один восточный язык. В её основе лежит арабское имя Габдельгани (вариант — Абдульгани), которое переводится как «раб Всебогатого» (в значении «раб Бога, обладающего безграничным богатством»). В татарской и башкирской среде это имя давали в честь одного из 99 эпитетов Аллаха — аль-Гани.

Самое интересное здесь — не корень, а суффикс. В русской передаче фамилия оформилась с помощью суффикса -ев (от основы на мягкий согласный), и это стандартная модель для фамилий тюркского происхождения, которые адаптировались в русской среде. Но есть нюанс: начальное «Гаптель» вместо привычного «Абдуль» или «Габдель» — это не ошибка, а живой процесс усечения. В устной речи арабское «абд» (раб) часто стягивалось до «ап» или «гап»: так, Габдельгани превращался в Гаптельгани, а от него уже образовали фамилию.

Вторая часть — «Ганиев» — встречается сама по себе как отдельная фамилия. Если бы фамилия звучала как Гаптельганиев, то она бы указывала на происхождение от человека по имени Гаптельгани. Но слог «-гап-» в начале — это именно сокращённая форма от «Габдель», что подтверждается множеством аналогичных фамилий у татар: Гаптельнуров, Гаптельхаков, Гаптельмазитов.

Географически фамилия тяготеет к Татарстану, Башкортостану и Оренбуржью. Сословно — скорее всего, крестьянская или купеческая среда: такие длинные составные фамилии с религиозным корнем часто давали в деревнях, где имя отца или деда становилось родовым прозвищем. В дореволюционных документах могла писаться по-разному: Гаптельганиев, Гаптель-Ганиев, реже — Аптельганиев.