Фамилия Гайфудинов — яркий пример того, как русская модель фамилии на -ов наложилась на арабское по происхождению имя. В основе лежит мужское имя Гайфутдин (варианты: Гайфетдин, Гайфудин), которое восходит к арабскому словосочетанию «гайф ад-дин» — «богатство веры» или «дар веры». Имя это составное: «гайф» (от араб. «гайб») означает «богатство», «изобилие», «тайна», а «дин» — «вера», «религия». В целом имя осмыслялось как «богатство религии» или «тот, кто обладает полнотой веры».

Фамилия образована по типичной для Поволжья и Приуралья модели: к тюрко-мусульманскому имени добавили русский патронимический суффикс -ов, превратив отчество в наследственную фамилию. То есть Гайфудинов — буквально «сын Гайфутдина». Суффикс -ин здесь не появился, потому что основа оканчивается на твёрдый согласный, а не на -а или -я. Встречается также вариант Гайфутдинов, где имя сохранено в более полной огласовке.

Географически фамилия распространена в Татарстане, Башкортостане, среди башкир и татар, а также в Оренбургской и Челябинской областях. В дореволюционной России носители фамилии относились в основном к сословию государственных крестьян, реже — к мещанству. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано: она сугубо народная, возникла в среде мусульманского населения, принявшего русскую фамильную систему в XIX веке после реформ.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, которые в русском языке часто теряют внутреннюю прозрачность, Гайфудинов сохраняет прямую связь с исходным именем. В татарском языке имя Гайфетдин до сих пор употребительно, а фамилия звучит как архаичное отчество, застывшее в письменных документах. Если сравнивать с однокоренными, то Гайфуллин (от имени Гайфулла — «богатство Аллаха») образован по той же модели, но с другим вторым компонентом.