Фамилия Гекря — редкий случай, когда основа не даёт очевидной подсказки ни о профессии, ни о внешности, ни об имени предка. В ней нет ни типичного русского суффикса -ов/-ев, ни -ин, ни -ский. Окончание -я наводит на мысль, что перед нами украинская, белорусская или южнорусская фамилия, записанная в форме прилагательного или прозвища без дополнительного фамильного форманта. В украинской ономастике такие фамилии на -я не редкость (например, Голобородько, Непийвода), но Гекря стоит особняком.

Скорее всего, в основе лежит прозвище, образованное от диалектного или заимствованного слова. Первая версия: корень «гек» может восходить к тюркскому «гек» (синий, небесный, зелёный) — в тюркских языках это частый компонент имён и прозвищ (ср. Гекташ, Гёкдениз). Если предок был светлоглазым или носил одежду определённого цвета, его могли прозвать Гек, а суффикс -ря (как в Кудря, Хитра) добавил оттенок пренебрежительности или принадлежности. Вторая версия: связь с немецким «geck» (дурак, шут, франт) — в южных губерниях России, где жили немецкие колонисты, такое прозвище могло прижиться и обрусе́ть, обрастая местными суффиксами.

Никаких известных носителей фамилии в исторических источниках не зафиксировано. Географически фамилия встречается единично — в основном на юге России и в восточной Украине, что подтверждает гипотезу о тюркском или диалектном происхождении. Сословная принадлежность не прослеживается, но по модели образования (прозвище + окончание -я) можно предположить, что предки были крестьянами или казаками, а не дворянами.

Таким образом, фамилия Гекря — скорее всего, прозвище, данное по цвету волос, глаз или одежды, либо по характеру. Точное значение сегодня восстановить трудно, но ясно одно: она не вписывается в стандартные русские фамильные модели и хранит следы языковых контактов на южных рубежах России.