Фамилия Гиргушкина — женская форма фамилии Гиргушкин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Гиргушка. Чтобы понять корень, нужно заглянуть в народную традицию имянаречения. Основа «Гирг-» — это, скорее всего, просторечная, усечённая форма крестильного имени Григорий (от греч. «грегорео» — бодрствующий, неспящий). В русских говорах имя Григорий «обкатывали» до множества уменьшительных вариантов: Гриша, Гриня, Гриха, Гирюта, Гирга. Форма «Гиргушка» — это уже с суффиксом -ушк-, который придаёт ласкательный или даже шутливый оттенок. Таким образом, Гиргушкин буквально означает «сын Гиргушки», то есть потомок человека, которого в быту звали Гиргушкой.

Модель образования здесь типичная для русских фамилий: суффикс -ин присоединяется к основе, оканчивающейся на -а/-я. Это указывает на принадлежность к роду: «чей?» — Гиргушкин, то есть из семьи Гиргушки. Мужская фамилия Гиргушкин склоняется по образцу притяжательных прилагательных, а женская Гиргушкина — по тому же образцу, но в женском роде. Важно, что фамилия редкая и не встречается в массовых списках распространённых русских фамилий, что говорит о её локальном бытовании.

Географически фамилия тяготеет к северо-западным и центральным регионам России, где формы имени Григорий с корнем «Гирг-» фиксировались в диалектах. Встречается она и в среде старообрядцев, которые нередко сохраняли архаичные варианты имён. В писцовых книгах и ревизских сказках XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с прозвищем Гирга или Гиргун — это подтверждает, что прозвище существовало в живой речи задолго до закрепления фамилии.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Гиргин, Гиргунов, Гирга — показывает, что все они восходят к одному источнику, но различаются суффиксами, которые определяли в разное время и в разных местностях. Гиргушкина — самая «ласкательная» из них, что может указывать на то, что родоначальник был младшим в семье или получил прозвище в детстве. Социальный статус предков, скорее всего, был крестьянским или мещанским: фамилии на -ин в этой среде были нормой, а дворянские роды предпочитали формы на -ов/-ев или -ский.