Фамилия Гиртциус — один из тех случаев, когда внешне немецкая или голландская фамилия оказывается латинской по происхождению, а по сути — книжной, учёной. Её носителями в России были, как правило, люди из среды образованного духовенства или профессуры, а сам корень восходит к латинскому Hirtius (Гирций) — римскому родовому имени, которое стало популярным в Европе эпохи Возрождения и Реформации.

В основе фамилии лежит латинизированная форма Hirtius (от hirtus — «косматый», «лохматый»). В XVI–XVII веках, когда в протестантских и католических университетах было модно давать студентам и выпускникам «классические» фамилии на -ius, многие немецкие пасторы, врачи и учителя превращали свои немецкие прозвища в латинские. Так, немецкое Hirt (пастух) или Hirte могло быть переделано в Hirtius, а затем, по модели многих фамилий того времени, к основе добавили немецкий суффикс -us (или, точнее, окончание латинского именительного падежа). В итоге получилась гибридная форма: латинский корень + латинское окончание, но сама фамилия бытовала в немецкоязычной среде.

В Российской империи фамилия Гиртциус встречалась прежде всего среди лютеранского духовенства и преподавателей немецких школ. Например, в Петербурге и Прибалтике (Эстляндия, Лифляндия) пасторы с такой фамилией служили в немецких приходах. Окончание -ус — характерный маркер фамилий, которые не прошли обрусение через суффиксы -ов/-ев или -ин. Это значит, что предок-носитель фамилии, скорее всего, сохранял немецкое самосознание и не переходил в православие (иначе фамилию могли бы адаптировать как Гиртциев или Гиртцов).

Важно не путать Гиртциус с более распространённой немецкой фамилией Hirt или Hirsch. Последняя означает «олень», а Hirt — «пастух». Гиртциус — именно латинизированная книжная форма, что указывает на университетское образование предка: в XVIII–XIX веках такие фамилии часто получали выпускники богословских и медицинских факультетов Кёнигсберга, Дерпта (Тарту) или Галле. Если ваш предок носил эту фамилию в России, он почти наверняка был пастором, учителем гимназии или врачом немецкого происхождения.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком: в русском ономастиконе нет продуктивной модели на -иус, это чисто западное заимствование. Поэтому при поиске корней стоит смотреть не в русские архивные фонды крестьян, а в метрические книги лютеранских церквей и списки студентов Дерптского университета.