Фамилия Гисунов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет прозрачного «ремесленного» корня, как у Кузнецовых, и нет очевидного крестильного имени, как у Ивановых. Чтобы понять её смысл, нужно посмотреть на суффикс и на возможные диалектные основы.

Первое, что бросается в глаза, — суффикс -ун-. В русских фамилиях он часто указывает на прозвище по действию или характерному признаку: говорун, ворчун, бегун. Соответственно, основа Гис- могла быть глагольной. Самый вероятный вариант — связь с диалектным глаголом «гисать» или «гысать». В некоторых южнорусских и украинских говорах «гысать» означало «кричать, плакать, шуметь». Прозвище Гисун могли дать крикливому, беспокойному человеку, а возможно, и ребенку, который много плакал. Фамилия Гисунов, таким образом, — это «сын Гисуна», то есть потомок человека с таким прозвищем.

Существует и другая, менее распространенная версия. В говорах встречается слово «гис» — так могли называть гуся, отсюда же фамилия Гусев. Но в случае с Гисуновым эта связь слабее: суффикс -ун для названия птицы нехарактерен, хотя в единичных случаях такое возможно. Правдоподобнее всё же первая — прозвищная, от глагола.

Географически фамилия Гисунов тяготеет к югу России, в частности к Ростовской области и Краснодарскому краю, а также к Украине. Это подтверждает версию о южнорусской диалектной основе. В центральных и северных регионах фамилия встречается редко.

В отличие от фамилий на -ин (от основ на -а/-я) или на -ов (от основ на согласный), модель на -ов от прозвища на -ун — классическая и распространенная. Однокоренные фамилии — Гисарев, Гисов, Гисенко — встречаются ещё реже, что говорит о локальном, «гнездовом» характере фамилии Гисунов. Сословной привязки нет: прозвище могло закрепиться как за крестьянином, так и за казаком, благо в южных областях казачество было сильно.