Фамилия Гийон — редкий для России случай, когда исконно русское родовое имя оказывается внешне неотличимым от французского. Если не знать контекста, можно решить, что перед вами потомок эмигранта или гугенот, бежавший в Россию. Но в действительности Гийон — это один из вариантов написания фамилии, которая произошла от православного имени Гай (или Гайй). В основе лежит каноническое имя Гай, которое носил, например, святой мученик Гай, пострадавший при Диоклетиане. В русской народной традиции это имя давали редко, но оно встречалось, особенно в южных и западных губерниях, где были сильны греческие и латинские влияния.

Словообразовательная модель здесь указывает на то, что фамилия оформлена по русскому принципу «от имени отца» с помощью суффикса -он, который в такой форме встречается нечасто. Обычно мы видим -ов или -ин, но в некоторых говорах, особенно под влиянием украинского или белорусского языков, суффикс мог давать форму на -он: Гай → Гайон → Гийон. Двойное «и» в начале — это результат аканья и последующей фиксации на письме: в безударном положении «а» и «о» звучали неотчётливо, а при записи фамилии в документах XIX века писарь мог записать «Гийон», услышав нечто среднее между «гайон» и «гойон». Таким образом, буквальное значение фамилии — «сын Гая», то есть «Гайев».

География фамилии подтверждает эту версию. Гийоны встречаются не в Париже, а в исторических областях расселения восточных славян — на Смоленщине, в Могилёвской губернии, на Брянщине. Там же бытуют однокоренные фамилии Гай, Гаев, Гайон. Если же корень фамилии действительно французский (от Guillon), то носители должны были бы концентрироваться в дворянских усадьбах или крупных городах, но массовых переселений французов в эти регионы не было. Поэтому версия о французском происхождении для русского Гийона — это красивая, но маловероятная легенда, возникшая из-за совпадения написания с известной фамилией французского философа и писателя.

Что касается социального статуса предков, то носители фамилии Гийон в массе своей относились к крестьянам или мещанам. Имя Гай не было княжеским или боярским, его давали простым людям. Фамилия не указывает на ремесло: это чисто патронимическое образование, которое говорит лишь о том, что предка звали Гаем. В редких случаях Гийон могло быть прозвищем, образованным от диалектного слова «гий» (в некоторых говорах — «глупый, чудной»), но это менее убедительное объяснение, так как прозвищная основа не дала бы устойчивого суффикса -он.