Фамилия Гляченков образована по модели, характерной для русских фамилий XIX века: основа + суффикс -ов (вариант -ев после мягких и шипящих согласных). В основе лежит прозвище или нецерковное имя Гляченок. Суффикс -енок (в старом написании -ёнок) в восточнославянских говорах указывал на молодое существо или детёныша — как в словах «котёнок», «утёнок». В прозвищах и фамилиях этот формант нередко означал «сын такого-то» или «младший член семьи». Таким образом, Гляченок — это «маленький Гляк» или «сын Гляка».

Корень «гляк» — тёмный и редкий. Наиболее вероятная версия: от глагола «глядеть» (смотреть). В русских диалектах «гляка» могло означать «глаз», «взгляд», а прозвище Гляк или Гляченок давали наблюдательному, зоркому человеку, либо, напротив, тому, кто любит подглядывать. Подобные прозвища по чертам характера или внешности — обычное дело в крестьянской среде, где фамилии часто закреплялись за целыми родами.

Менее правдоподобная, но допустимая версия — связь с диалектным словом «гляк» (звукоподражание крику птицы) или с личным именем Глеб (через народную форму Гляк). Однако лингвистического подтверждения этому нет, и версия с «глядеть» остаётся основной.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям (Тульская, Рязанская, Орловская губернии), где были распространены фамилии на -енков. Встречается также вариант Гляченков с ударением на второй слог, что соответствует типичному акценту в этих регионах. Сословно носители фамилии — почти поголовно крестьяне, реже — однодворцы.

В написании фамилии возможна путаница: иногда её записывали как Глячёнков (с буквой «ё»), что отражает живое произношение. Но в официальных документах закрепилось написание через «е». Сравните с однокоренными фамилиями Глядков, Гляделкин, Глядчиков — все они восходят к тому же корню, но Гляченков стоит особняком из-за редкого суффикса, что делает её более локальной и узнаваемой.