Фамилия Гнуни — редкий случай в русском ономастиконе. Сразу бросается в глаза окончание -и, которое для русских фамилий нетипично. В большинстве случаев фамилии на -и (Гнуни, Гуни, Гнути) имеют не русское, а армянское происхождение. В армянском языке суффикс -уни указывает на принадлежность к знатному роду или на географическое происхождение. Таким образом, Гнуни — это, скорее всего, армянская фамилия, а не славянская.

Если же рассматривать гипотезу о русском корне, то здесь открывается поле для догадок. Основа «гну-» может восходить к глаголу «гнуть». В русских говорах «гнутый» — это не только согнутый предмет, но и человек с изъяном (горбатый, сутулый) или, наоборот, хитрый, изворотливый. Однако для образования фамилии от такого прозвища в русском языке использовались бы суффиксы -ов, -ев или -ин (Гнутов, Гнутиков), а не окончание -и. Поэтому версия с «гнуть» маловероятна — она не объясняет главную особенность фамилии.

Стоит обратить внимание и на то, что фамилия Гнуни встречается в основном на Кавказе и в Закавказье, что подтверждает армянскую версию. В Армении известен дворянский род Гнуни, упоминания о котором восходят к эпохе древнеармянского царства. Согласно историческим хроникам, Гнуни были нахарарами (князьями) и владели землями в провинции Айрарат. Таким образом, если ваши предки носили эту фамилию, с высокой вероятностью они происходят из армянской аристократической среды, а не из крестьянской или казачьей.

Разобраться в этимологии помогает и сравнение с другими фамилиями той же модели: Мамикони, Арцруни, Рштуни. Все они указывают на родовую или территориальную принадлежность в древней Армении. Фамилия Гнуни стоит в этом ряду, и её носители, скорее всего, вели свой род от конкретного княжеского дома. В русском контексте эта фамилия — пришлая, и её появление связано с миграциями армян в Российскую империю в XVIII–XIX веках. Никакого отношения к русскому слову «гнус» или «гнуться» она не имеет.