Фамилия Гоанесян — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает этимологическую. С первого взгляда она кажется армянской: суффикс -ян указывает на принадлежность или происхождение («из рода такого-то»). Но основа Гоанес не даёт покоя — в армянском языке нет такого распространённого имени или корня.

Здесь, скорее всего, работает модель, знакомая ономастам: фамилия могла возникнуть на стыке культур. Вариант первый — перед нами русифицированная или искажённая запись армянской фамилии Ованесян (от имени Ованес, аналог Иоанна). В метрических книгах и советских паспортах начала XX века начальное «О» нередко заменяли на «Го» под влиянием украинского или южнорусского произношения (с придыхательным «г»). Второй вариант — фамилия могла принадлежать армянину, жившему в греческой или болгарской среде, где имя Гоанес (возможно, от греческого Иоаннис) бытовало как самостоятельное, а суффикс «-ян» закрепился как родовой маркер.

Если отбросить гипотезу об искажении, придётся признать, что корень Гоанес — либо местное прозвище (например, от турецкого или курдского слова, означающего пастуха или земледельца), либо фамилия, образованная от названия населённого пункта. Документальных подтверждений топонима «Гоанес» нет, но в Закавказье и Северо-Восточной Турции существовали микротопонимы, не попавшие в крупные справочники.

Социальный контекст типичен для армянских фамилий на -ян: носители в основном были ремесленниками, торговцами или крестьянами из восточных провинций Османской империи, переселившимися в Российскую империю после 1915 года. Сословной элиты среди Гоанесян не зафиксировано — это фамилия простого люда, сохранившая память о конкретном человеке или месте, которое сейчас уже не найти на карте.