Фамилия Голищенко — типичный пример украинской модели образования фамилий на -енко. На востоке Украины, где этот суффикс особенно распространён, он указывал на «сына» или «потомка» человека, названного в основе. В данном случае основа — Голищ(а) или Голищ(о), а суффикс -енко добавляет значение «чей-то отпрыск».

Корень «Гол-» почти наверняка отсылает к слову «голий» — то есть голый, бедный, не имеющий имущества. В украинском языке «голий» сохраняет то же значение, что и в русском. Прозвище Голища могли дать человеку за крайнюю бедность, за отсутствие одежды или, в переносном смысле, за простоту и непритязательность. Встречается и другая версия: в некоторых говорах «голица» — это рукавица, но для фамилии такое объяснение менее вероятно, так как прозвища от названий одежды обычно образуются иначе.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Голик, Голый, Голиков — показывает, что все они связаны с той же характеристикой «бедный, неимущий». Но Голищенко стоит особняком: суффикс -енко делает её более поздней по времени, чем, скажем, Голиков. Такие фамилии активно формировались в XVI–XVII веках, когда на землях Речи Посполитой, а затем Гетманщины, шёл процесс закрепления прозвищ за целыми родами.

Носители фамилии Голищенко традиционно сосредоточены на Украине — в Черниговской, Полтавской, Сумской областях, а также на Кубани и в южных регионах России, куда переселялись украинские казаки. Встречаются варианты с ударением на второй слог — Голи́щенко, что для этого типа фамилий редкость: обычно ударение падает на -енко.

Таким образом, предок современных Голищенко, скорее всего, был человеком, которого в своём селе знали как «Голищу» — бедняка или того, кто ходил в обносках. Прозвище, данное ему, со временем закрепилось за его детьми и внуками, став фамилией.