Фамилия Голубовский образована по типичной для украинских и польских земель модели: к основе прозвища Голуб добавился суффикс -овск-, который превратил личное прозвище в фамилию, указывающую на принадлежность роду или месту. В русской традиции этот суффикс чаще встречается у дворянских фамилий, образованных от названий имений, но у Голубовских связь с географическим названием необязательна — основа прозвищная.

Корень фамилии — «голуб», то есть голубь. Прозвище Голуб в старину давали не только за внешнее сходство (мягкий, округлый, с серыми глазами) или за характер (кроткий, мирный, ласковый человек). Была и практическая сторона: голубем могли прозвать голубятника — человека, который держал и разводил этих птиц. В крестьянском быту голуби ценились и как почтовые птицы, и как источник мяса, так что такое занятие было заметным.

Стоит отдельно сказать о поверье, которое часто упоминают в связи с этой фамилией. Считалось, что нечистая сила не может обернуться голубем — только козлом, кошкой или собакой. Поэтому имя Голуб могло выполнять и охранительную функцию: родители надеялись, что ребёнка с таким прозвищем обойдут стороной злые духи. В народной культуре это усиливало положительный смысл имени.

В написании фамилии встречаются варианты: Голубовский и Голубовський (с мягким знаком на конце). Первый вариант закрепился в русскоязычной среде, второй — в украинской. Встречается и более редкая форма с двойным «с» — Голубовський, но это уже следствие поздней канцелярской записи.

О точном месте и времени возникновения фамилии Голубовский говорить сложно: процесс формирования фамилий на восточнославянских землях растянулся на несколько столетий, и похожие фамилии могли независимо появиться в разных регионах. Однако можно уверенно сказать, что в основе лежит не географическое название, а личное прозвище, что делает фамилию более древней по типу происхождения, чем, например, «княжеские» фамилии на -ский.