Фамилия Гомцян — армянская, и её разумнее всего начинать разбирать с финальной части, которая сразу указывает на происхождение. Суффикс -ян (в старой орфографии -янц) — один из главных родовых показателей в армянской ономастике. Он означает «из семьи» или «из рода», то есть Гомцян — это буквально «из рода Гомца». Такая модель образования фамилий сложилась в Армении примерно к XIV–XV векам, когда родовые имена стали закрепляться за потомками.

Основа фамилии — «Гомц» — скорее всего, восходит к армянскому слову gomesh (գոմէշ), что значит «буйвол». В армянской традиции имена, образованные от названий животных, встречались нередко: они несли в себе пожелание силы, выносливости или просто отражали внешность человека. В данном случае возможны два варианта. Первый: Гомц — это личное имя, которое дали ребёнку, чтобы он рос крепким, как буйвол. Второй: прозвище Гомец или Гомц мог получить взрослый человек — либо владелец большого стада буйволов, либо кто-то с мощным, грузным телосложением, напоминавшим это животное. Оба объяснения логичны и не противоречат армянской антропонимике.

Менее вероятная, но всё же упоминаемая в разговорах версия связывает фамилию с топонимом — названием села или местности. Однако прямых подтверждений, что в Армении существует или существовал населённый пункт Гомц (или Гомеш), нет, поэтому гипотеза о прозвище или имени остаётся основной.

Фамилия Гомцян не относится к числу самых распространённых в Армении, но встречается как в исторических областях Восточной Армении, так и в диаспоре. Носители фамилии, вероятно, происходят из регионов, где традиционно держали буйволов — это равнинные и предгорные районы, например, Араратская долина или окрестности озера Ван. В советское время часть Гомцянов переселилась в Россию, где фамилия иногда записывалась с упрощённым окончанием — Гомцов, но в основной своей массе сохранила исходную форму.