Фамилия Гозюкнчан — редкий случай, когда написание подсказывает больше, чем звучание. С высокой вероятностью перед нами искажённая при записи или переезде фамилия тюркского происхождения. Основа «гозюк» (или «гозюк») восходит к тюркскому слову göz — «глаз», а суффикс -ük в некоторых диалектах образует уменьшительные или ласкательные формы. Таким образом, «Гозюк» могло быть прозвищем человека с выразительными, большими или, наоборот, маленькими глазами — типичная для тюркской антропонимии характеристика по внешности.

Второй компонент «нчан» — самый тёмный. Скорее всего, это не отдельная морфема, а результат слияния с русским патронимическим суффиксом -ан или -ян (как в фамилиях Григорян, Оганян). В таком случае исходная форма могла быть Гозюкян или Гозюкчан, где -ан/-ян — указание на принадлежность роду. Но написание с «н» в середине (Гозюкнчан) наводит на мысль об описке или диалектном произношении: в некоторых говорах конечный «н» мог удваиваться или смещаться. Встречающийся вариант «Гозюкчян» (с «ч» вместо «к») подтверждает, что фамилия прошла через несколько этапов адаптации.

Географически фамилия Гозюкнчан, судя по скудным данным, тяготеет к регионам с сильным тюркским влиянием — например, к Поволжью, Крыму или Северному Кавказу, где фамилии на -ян/-ан распространены у армян, греков и тюркских народов. Однако чистый тюркский корень без армянского суффикса (Гозюков, Гозюклы) встречается чаще, поэтому «нчан» может быть искажением диалектного окончания -джан (как в азербайджанских фамилиях).

Версия о славянском происхождении маловероятна: ни один славянский суффикс не даёт такого сочетания. Остаётся считать, что предок носителя фамилии был прозван Гозюк (Глазастик) в тюркоязычной среде, а при оформлении документов в Российской империи фамилию записали с ошибкой или с местным акцентом, закрепив редкую форму.