Фамилия Гцсев — редкий случай, когда написание расходится с произношением настолько, что затрудняет поиск корня. В основе, скорее всего, лежит не буква «ц», а диалектное или искажённое «ч» или «с». Первое, что приходит в голову: это вариант фамилии Гусев, записанный на слух в регионе, где «ц» и «ч» не различали (цоканье). В псковских, новгородских или тверских говорах слово «гусь» могли произнести как «гуць», а от него образовать отчество «Гуцев». При переписи или в церковной книге малограмотный писец мог зафиксировать услышанное как «Гцсев», пропустив гласную или переставив буквы. Такие «глухие» написания — не редкость в метрических книгах XIX века, где фамилию записывали со слов крестьянина, не умевшего читать.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: основа «Гц-» может восходить к редкому прозвищу Гца или Гц, которое, в свою очередь, связано с диалектным глаголом «гцать» (гнать, торопить) или звукоподражанием. Однако ни в одном серьёзном ономастическом словаре (ни у Унбегауна, ни у Веселовского) фамилия Гцсев не упоминается — это говорит о её крайней локальности и, возможно, единичности.

Суффикс «-ев» указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей?» — «Гцсев», то есть сын человека по прозвищу или имени Гцс (или Гуц). Если принять версию о происхождении от «Гусь», то фамилия входит в обширный ряд «птичьих» фамилий (Гусев, Гусынин, Гусаков), но с характерным диалектным искажением.

Географически Гцсев почти наверняка привязан к зоне северо-западных или северных говоров России — Архангельская, Вологодская, Псковская области. В современных базах данных фамилия встречается единично, что подтверждает её угасание или трансформацию в более привычное написание. Для носителя фамилии Гцсев это почти наверняка не ошибка предка, а живое свидетельство того, как звучала русская речь в конкретной деревне сто-двести лет назад.