Фамилия Губинские — типичный пример «географической» фамилии, образованной по модели, распространённой в основном на западе и юге России, а также в Беларуси и Польше. Суффикс -ск- указывает на связь с местностью: такую фамилию давали человеку, который был родом из села или поместья, носившего название Губино. В отличие от фамилий на -ов/-ев (Губин), которые возникали от личного прозвища или имени отца, фамилии на -ский чаще закреплялись за дворянством и духовенством, но со временем распространились и среди крестьянства, особенно после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным массово присваивали фамилии по названию деревни.

Деревень и сёл с названием Губино на территории России и сопредельных государств десятки. Одни из них находятся в Московской, Тверской, Псковской, Витебской областях. Название этих населённых пунктов, как правило, происходит от некалендарного древнерусского имени или прозвища Губа — так в старину могли назвать человека с крупными или пухлыми губами, либо обидчивого, «надутого». Впрочем, существует и версия, что в некоторых говорах «губа» означала залив или изгиб реки, и селение Губино могли назвать по особенностям ландшафта.

Таким образом, родоначальник Губинских — это человек, который переселился из какого-то Губина и получил прозвание «Губинский», то есть «тот, кто из Губина». Поскольку процесс закрепления фамилий шёл в разных регионах в разное время (с XVI по XIX век), установить точную географическую точку, откуда пошла именно эта ветвь, без генеалогического исследования невозможно. Однако уже сам суффикс -ск- подсказывает, что фамилия сформировалась не в новгородских или московских землях, где господствовали патронимические модели, а скорее на территории, испытавшей влияние польской или западнорусской ономастической традиции.