Фамилия Губка образована от аналогичного прозвища, в основе которого, скорее всего, лежит нарицательное «губка». Даля оно трактуется как «шерсть или хлопок, который кладется в ветошку для наводки лака, политура». Возможно, предок обладателя фамилии был столяром. Не исключено также, что прозвище Губка восходит к существительному «губа». В таком случае можно предположить, что прозвище отражало особенности внешности человека: у родоначальника фамилии могли быть полные губы.