Фамилия Губузащёкин — один из ярких примеров русских прозвищных фамилий, где слово-основа сохранила живую, почти гротескную картинку. В отличие от большинства фамилий, образованных от крестильных имён или профессий, эта явно родилась из уличного прозвища, которое дали человеку за приметную внешность. Разберём её по составу: основа «губузащёк» — это сращение двух слов «губа» и «щёка». Скорее всего, прозвище Губузащёк или Губы-Защёки получил человек с крупными, толстыми губами и одновременно полными или отвислыми щеками. В русской традиции такие бытовые прозвища, метящие во внешность, были обычным делом в крестьянской и посадской среде до XIX века.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Губузащёкин — значит «сын Губузащёка» или «из семьи Губузащёка». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще давались от основ на твёрдый согласный, здесь мы видим именно притяжательное значение. Сама фамилия редкая и, вероятно, имеет локальное бытование — такие сложные прозвищные фамилии часто закреплялись в одном-двух сёлах или уездах, где прозвище было известно всем соседям.

Интересно, что фамилия не подверглась «оглаголиванию» и не превратилась в более благозвучный вариант. В официальных документах XIX века при переписях крестьян прозвища нередко заменяли на более нейтральные, но здесь, видимо, прозвище было настолько цепким, что вошло в паспорт. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные составные прозвища на «губа» и «щёка» встречаются, но Губузащёкин — случай почти уникальный по спаянности корней.

Версия о том, что фамилия могла произойти от названия ремесла или места, маловероятна: ни «губузащёк», ни «губузащёка» не зафиксированы как термины. Остаётся только портретная гипотеза: предок носителя фамилии был, по всей видимости, человеком с очень выразительным лицом, и эта черта закрепилась за его потомками. Сословно — почти наверняка крестьяне или мещане, поскольку дворянские фамилии редко образовывались от столь откровенных прозвищ.