Фамилия Гуейнова — редкий пример, где написание расходится с произношением сильнее, чем обычно. На слух она почти неотличима от Гуенова, а на письме сохраняет «й», которое в русской орфоэпии в этом положении не произносится. Этот графический след — ключ к происхождению.

Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища или имени Гуей. В русских говорах, особенно южнорусских и украинских, «гуй» — устаревшее слово со значением «глупец», «простофиля». Оно фиксируется в диалектных словарях, но уже в XIX веке считалось грубоватым. От него через притяжательное прилагательное (Гуев) и суффикс -н- (Гуев + н + ов) могла возникнуть форма Гуейнов, а затем — с фамильным окончанием -а: Гуейнова. Впрочем, суффикс -н- в данном случае необычен: обычно от прозвища на -ей образовывали фамилии напрямую, без наращения (ср. Гусев от Гусь, а не Гусьнев). Поэтому стоит рассмотреть и другую версию.

Не исключено, что в основе лежит не славянское, а тюркское или кавказское имя Гуей, Гуй или Гуя. В ряде тюркских языков корень со значением «сила», «мощь» давал личные имена (ср. башкирское Гуй — «богатырь»). При адаптации в русской среде такое имя могло получить суффикс -ов, а «й» в конце основы сохранилось как орфографическая дань исходному звучанию. География фамилии подтверждает эту гипотезу: Гуейновы встречаются в основном в Поволжье и на Северном Кавказе — в регионах активных русско-тюркских контактов.

С социальной точки зрения фамилия явно крестьянская или казачья, без дворянских корней. Суффикс -ов типичен для массового образования русских фамилий в XVI–XVII веках, когда прозвища и имена превращались в наследственные. Редкость фамилии говорит о том, что её носители долго жили компактно, в одном селе или станице, и не рассеивались по стране.

Итог: перед нами фамилия-загадка, где написание подсказывает путь, но не даёт однозначного ответа. Тюркская версия выглядит убедительнее из-за региональной привязки и нестандартной для славянской модели словообразования.