Фамилия Гугусиани — яркий образец грузинской антропонимии, и её разговор стоит начать с суффикса, который сразу указывает на происхождение. Формант -ани характерен для восточной Грузии, особенно для региона Кахетии и исторической провинции Эрети. Такие фамилии первоначально означали принадлежность к роду или местности: «Гугусиани» — «из дома Гугуса» или «относящийся к Гугусу».

Основа «Гугус» — это, скорее всего, сокращённая форма грузинского мужского имени Гугуша или Гугуна. В грузинской ономастике такие уменьшительно-ласкательные имена (с повторением слога «гу») нередко давали детям, а со временем они закреплялись как прозвища. Корень «гуг» может восходить к древнегрузинскому слову, означающему «кукушка» (гугули), но это лишь одна из версий, менее вероятная для личного имени. Правдоподобнее, что перед нами вариант имени Георгий, адаптированного в народной среде: от Гиги, Гугуша до Гугус — типичная для Кавказа цепочка сокращений.

Географически фамилия Гугусиани встречается прежде всего в Грузии, но также фиксируется в Абхазии и среди грузинской диаспоры в России. Известно, что носители этой фамилии в XIX веке числились среди крестьян и мещан Тифлисской губернии, что подтверждается адрес-календарями Российской империи. Сословной элиты среди Гугусиани не было — это фамилия простых людей, земледельцев или ремесленников.

В написании фамилии нет разнобоя: окончание -иani однозначно указывает на грузинский патроним, а не на русское -ов или -ин. Поэтому любые попытки вывести её из славянских языков (например, от «гугус» как звукоподражания) лишены оснований. Если искать аналоги, то в той же Грузии есть фамилии Гугучия, Гугунава, Гугулиа — все они образованы от одного корня, но с разными суффиксами, указывающими на регион или конкретный род.