Фамилия Гуковские (в исходной форме Гуковский) имеет украинские корни. Её основа — прозвище Гук, а суффикс -ский указывает на характерное для украинской и польской ономастики образование фамилий по территориальному или родовому признаку. В старину такие фамилии часто получали шляхтичи или казаки, владевшие землёй или происходившие из определённой местности.

Прозвище Гук связывают с глаголом «гукать». В разных говорах у этого слова свои оттенки: где-то оно означало «громко звать, кричать», в южных диалектах — «играть на гуке» (так называли народный музыкальный инструмент наподобие дудки или рожка). Есть и версия, что «гукать» значило «говорить» или даже «ударить». Поэтому Гуком могли прозвать как человека с громким голосом или болтливого, так и музыканта, игравшего на гуке.

Фамилия Гуковские — не единственная в этом ряду. Однокоренные Гук, Гуков, Гукалов, Гукасов встречаются у украинцев, белорусов и поляков. Суффикс -ский помимо указания на происхождение от прозвища мог также означать принадлежность к селению с названием Гуково или Гуковка. Такие топонимы есть на территории современной Украины и Польши, что даёт ещё одну версию: предки Гуковских могли получить фамилию по месту жительства или владения.

Точное время и место появления фамилии установить сложно — процесс формирования фамилий у славян растянулся на несколько столетий. Однако ясно, что Гуковские — потомки человека, выделявшегося либо ремеслом, либо характером, и эта фамилия сохранила память о его прозвище.