Фамилия Гурунян почти наверняка имеет армянское происхождение, и её ключ к разгадке — суффикс -ян (варианты: -янц, -енц). Этот суффикс — основной маркер армянских фамилий, образованных по модели «сын такого-то» или «из рода такого-то». В русской традиции окончание часто адаптировали, убирая конечное «ц», поэтому Гурунян — это русифицированная форма от исходного Гурунянц.

Основа фамилии — Гурун — может восходить к нескольким корням. Самый прямой вариант: армянское слово «гур» (գուր) или «гурук» (գուրուկ) — в диалектах это могло означать «гордый», «надменный», «суровый» или даже «упрямый». Прозвище Гурун дали бы человеку с таким характером. Менее вероятная, но возможная версия — связь с топонимом: в Армении есть село Гурун (в исторической области Сюник), и фамилия могла указывать на выходца оттуда. Третья гипотеза — искажение личного имени Гурген (через форму Гуру), но для этого нет устойчивых лингвистических подтверждений.

По модели образования фамилия типична для восточноармянских регионов (современная Армения, Нагорный Карабах). В западных диалектах (территория исторической Западной Армении, ныне в Турции) чаще использовали суффикс -янц, но в переселенческой среде XIX века он мог сократиться. Социальный состав носителей — преимущественно крестьяне и ремесленники, так как фамилии на -ян в массе своей закрепились именно за простыми сословиями в ходе массовой паспортизации в Российской империи (вторая половина XIX века).

Фамилия редкая. В современной России и Армении её носители — это, скорее всего, потомки выходцев из одной локальной группы. Сравнение с однокоренными фамилиями (Гурунц, Гурунянц) показывает, что корень «гур» в армянской ономастике встречается нечасто, что делает фамилию относительно уникальной — без широкого «родственного» круга.