Фамилия Гущченко — яркий пример украинской модели образования фамилий на -енко. Суффикс -енко, распространённый в центральных и восточных регионах Украины, исторически означал «маленький» или «сын», то есть Гущченко — это «сын Гущки» или «потомок Гущки». Такие фамилии формировались в XVI–XVII веках, когда прозвище отца переходило к детям с этим патронимическим суффиксом.

Основа фамилии — прозвище Гущ(к)а, которое имеет два основных объяснения. Первое и самое вероятное: от украинского слова «гуща» — густая заросль, чаща, а также гуща (осадок) в жидкости. Прозвище могли дать человеку, живущему в лесистой, заросшей местности, либо тому, кто варил пиво или квас и оставлял много гущи. Второе объяснение — от диалектного «гущ» (глухой звук, гул) или от глагола «гущати» (делать гуще). Менее вероятная, но возможная версия — связь с именем Гурий (в просторечии Гуща), хотя такое сокращение встречается редко.

Двойное «щ» в написании Гущченко — не ошибка, а закономерность украинской фонетики. При добавлении суффикса -енко к основе Гущ- происходит чередование: основа на -щ даёт -щч- (как в слове «дощ» — «дощовий»). В русском языке эту фамилию иногда упрощают до Гущенко, но исходная форма сохраняет двойной согласный, указывающий на украинское происхождение.

Сословно фамилия Гущченко не была дворянской. Она относилась к крестьянским и казацким родам Левобережной Украины. Наибольшая концентрация носителей исторически фиксируется в Черниговской, Полтавской и Сумской областях — регионах, где суффикс -енко доминировал в фамилиях простого люда. В списках реестровых казаков XVII века встречаются однофамильцы с похожими прозвищами, но прямых документальных упоминаний фамилии Гущченко в ранних источниках нет — это говорит о её более позднем закреплении, вероятно, в XVIII веке.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Гущенко (без двойного «щ») — более русифицированный вариант, Гуща — исходное прозвище без суффикса, Гущин — русская форма на -ин. Все они восходят к одному корню, но Гущченко сохраняет самую архаичную украинскую словообразовательную модель.