Фамилия Гянджунцев — редкий случай, когда географическое название и тюркское слово сплелись в одной основе, а суффикс выдает позднее оформление на русской почве. Начинать стоит с самого необычного — с корня «Гяндж-». Он восходит к названию древнего города Гянджа на территории современного Азербайджана. Вторая часть «-ун» могла быть тюркским аффиксом принадлежности, а «-джун» — искаженным «джан» (душа, человек) или частью сложного прозвища. В итоге основа фамилии означает что-то вроде «относящийся к Гяндже» или «человек из Гянджи».

Суффикс «-ев» типичен для русских фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или «ц». Здесь он присоединен к тюркскому прозвищу Гянджун (или Гянджунц), которое закрепилось за предком. Вероятнее всего, фамилия сформировалась в среде, где тюркские имена и прозвища адаптировались к русской модели: сын Гянджуна стал Гянджунцевым. Вариант написания через «ц» подсказывает, что в основе могла быть форма на «-унц», характерная для армянских фамилий (ср. Айвазян -> Айвазунц), но затем она обрусела.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Северному Кавказу, особенно к Ставрополью и Ростовской области, где исторически смешивались русские, армянские и тюркские фамилии. Предок носителя мог быть выходцем из Гянджи — купцом, ремесленником или переселенцем, который в XIX–XX веках перебрался в русскоязычную среду. Менее вероятна связь с персидским «гяндж» (сокровище), так как суффикс «-унцев» нехарактерен для иранских языков.

Словообразовательная модель здесь редкая: основа «Гянджунц» плюс русский суффикс «-ев» даёт уникальное сочетание, которого нет у массовых фамилий. В отличие от привычных Ивановых или Кузнецовых, Гянджунцев сразу указывает на географическую точку на карте. Это не прозвище по профессии или внешности, а метка происхождения, сохранившая память о городе, который старше многих европейских столиц.