Фамилия Илтубае — редкий случай, когда основа фамилии почти наверняка не славянская, а тюркская, причём с чёткой географической привязкой к Волго-Уральскому региону. Формально фамилия образована по русской модели: к основе «Илтуба» добавили типичный русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного). Но сама основа — это адаптированное тюркское имя или прозвище.

Разбираем корень. Первая часть «Ил» в тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) означает «родина», «народ», «страна» или «мир». Вторая часть «туба» — более спорный элемент. Наиболее вероятное объяснение: это искажённое «тубай» или «туба» со значением «стойкий», «крепкий», «опора». В татарской антропонимике есть составные имена вроде Илтуган (родич народа) или Илдар (властитель страны). Илтубай могло означать «опора народа» или «стойкий за родину». Менее вероятно, но не исключено, что «туба» восходит к арабскому «туба» (блаженство, райское дерево) — тогда имя приобретает религиозный оттенок, но для тюркских имён такая конструкция встречается реже.

По суффиксу -ев видно, что фамилия закрепилась в русской среде не раньше середины XIX века, когда массово давали фамилии крещёным татарам, башкирам и другим народам Поволжья. Носители фамилии Илтубае — это, скорее всего, потомки служилых татар или башкир, которые перешли в православие и получили фамилию по имени отца (Илтубай → сын Илтубая → Илтубаев). В документах фамилия могла писаться и как Илтубаев, но вариант Илтубае (без конечного -в) — это либо усечённая форма, характерная для некоторых говоров, либо результат ошибки писаря при записи.

Географически фамилия тяготеет к территориям бывшей Казанской, Уфимской и Оренбургской губерний. Встречается она редко, что подтверждает её узколокальное происхождение: вероятно, от одного конкретного рода. Если ваш предок носил фамилию Илтубае, он почти наверняка был выходцем из татарской или башкирской среды, крещёным в православие, а его отца звали Илтубай — человеком, которого в общине считали опорой или стойким защитником своего народа.