Фамилия Илзенец — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычных русских суффиксов -ов или -ин, что сразу указывает на нерусскую основу. Скорее всего, перед нами фамилия западнославянского или балтийского происхождения, адаптированная под русское окончание.

Ключ к разгадке — суффикс -ец. В славянских языках он часто указывает на принадлежность к местности: «житель такого-то места». Например, «могилевец» — из Могилёва, «варшавец» — из Варшавы. Корень «Илзен-» может быть вариантом названия населённого пункта. Наиболее вероятная версия: фамилия образована от топонима Илзен (Ilsen) или Ильзен (Ilzen). Такое название встречается в Германии (Ильзенбург) и в исторических областях Польши (Илзен — деревня в Силезии). Носитель фамилии Илзенец — выходец из этих мест.

Есть и вторая, менее вероятная гипотеза: основа восходит к личному имени. В славянских землях бытовало имя Ильза (как вариант Елизаветы), а суффикс -енец мог указывать на потомка или человека, связанного с носительницей этого имени. Однако для фамилии с окончанием -ец топонимическая версия всегда убедительнее.

Написание фамилии с буквой «з» (Илзенец, а не Ильзенец) — скорее всего, результат адаптации при переходе в русскую среду. В оригинале могло быть мягкое «ль» (Ilzen), которое на письме отвердело. Такое часто случалось с фамилиями немецких и польских переселенцев, оседавших на территории Российской империи в XVIII–XIX веках.

Таким образом, Илзенец — фамилия-топоним, указывающая на географическое происхождение предка. Носители этой фамилии, скорее всего, происходят из западнославянских или прибалтийских земель, а в Россию попали в результате миграций, возможно, в составе колонистов или военных.