Фамилия Ильзетинов — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа, суффикс и вероятная география говорят о том, что перед нами фамилия, скорее всего, тюркского происхождения, адаптированная русской патронимической моделью.

Разбор начинаем с суффикса. Формант -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Ильзетинов, то есть сын Ильзетина. Это типичный русский способ оформления фамилий от основ на -а/-я. Но сама основа Ильзетин — не русская. Она явно восходит к личному имени или прозвищу, которое можно разложить на две части.

Первая часть — Иль- (Иль, Ильяс). Это арабское имя Ильяс (библейский Илия), широко распространённое у тюркских и кавказских народов. Вторая часть — -зетин (или -зет). Здесь возможны два варианта, и оба ведут в тюркские языки.

Наиболее правдоподобная версия: Ильзетин — это стяжённая форма от тюркского имени Ильясетдин (вариант — Ильяседдин). В арабо-тюркской ономастике «Сетдин» (Садр ад-Дин) означает «грудь веры» или «глава веры». Сложное имя Ильяс-эд-Дин при частом произношении могло сократиться до Ильзетин: выпал слог, согласные сблизились. Такие стяжения — обычное дело в живой речи башкир, татар, казахов.

Вторая, менее вероятная версия: зетин — искажённое тюркское zäki (умный, сообразительный) с добавлением аффикса. Но имя Ильзаки встречается реже, а фонетический переход «к» в «т» в этой позиции нехарактерен.

Таким образом, фамилия Ильзетинов образована от мужского личного имени Ильзетин (Ильясетдин). Носитель такого имени — человек, названный в честь пророка Ильяса и получивший религиозный эпитет. Фамилия закрепилась в среде поволжских татар или башкир, где такие имена были обычны, а затем была русифицирована добавлением -ов.

В дореволюционной России фамилия могла принадлежать как представителям духовенства (муллам, муэдзинам), так и крестьянам или торговцам — имя не было строго сословным. Сегодня фамилия встречается крайне редко, в основном в Башкортостане, Татарстане и среди мигрантов из этих регионов. Встречаются варианты написания с одной «н» (Ильзетинов) — это описка или особенность паспортной записи, так как суффикс -ин требует двойного «н» только при ударении на основу (сравни: Ильин — Ильинин). Здесь ударение, скорее всего, падает на второй слог: Ильзéтинов.