Фамилия Имагамаева — редкая и сложная для однозначной этимологии, так как её основа не является ни типично славянской, ни тюркской в привычном понимании. Скорее всего, она образована от мужского имени Имагама, которое представляет собой вариант или производное от арабского имени Мухаммад (Магомед). В тюркских и кавказских языках, особенно у народов Дагестана и татар, имя Мухаммад могло трансформироваться в Имагама, Имамгама или Имам, а суффикс «-ев» (или «-ова» в женском варианте) указывает на принадлежность: «сын Имагамы» или «из рода Имагамы». Таким образом, фамилия Имагамаева — это патроним, образованный по русской словообразовательной модели от восточного имени.

Наиболее вероятная географическая привязка — Северный Кавказ, особенно Дагестан, где фамилии с окончанием «-ев» распространены среди многих народов (аварцы, даргинцы, чеченцы). Вторая возможная зона — Поволжье, среди казанских татар, у которых также встречаются подобные формы. Встречаемость фамилии очень низкая, что говорит о её локальном происхождении: вероятно, она закрепилась за одним родом или несколькими родственными семьями в конкретном ауле или деревне.

Обратим внимание на суффикс «-аев», который характерен для многих дагестанских фамилий, пришедших в русскую документацию. В отличие от русских фамилий на «-ов» (от основ на согласный), здесь основа оканчивается на «-а», что типично для имён, заимствованных из арабского или тюркского. Вариант «Имагамаева» (с ударением, скорее всего, на третьем слоге) — женская форма; мужская будет Имагамаев.

Споров о происхождении мало: альтернативная версия, что основа восходит к тюркскому слову «имам» (духовный лидер) с добавлением «гама» (от араб. «хамма» — хвала), маловероятна и является натяжкой. Правдоподобнее всего считать, что в основе лежит имя Мухаммад в местном произношении, записанное русскими чиновниками на слух. Предки носителей фамилии, скорее всего, были горцами или крестьянами-мусульманами, и фамилию они получили при переписях или в советское время, когда паспортизация закрепила за ними родовое прозвище по отцу.