Фамилия Иманяев образована по распространённой в тюркских языках модели: основа плюс суффикс принадлежности -ев/-ов. Суффикс указывает на то, что фамилия сформировалась в русской среде или под русским административным влиянием, но корень у неё явно не славянский. Основа — Иманяй — это личное имя или прозвище.

Самое вероятное объяснение: Иманяй — это вариант тюркского имени Иман (от арабского «иман» — вера) с уменьшительно-ласкательным аффиксом -ай, характерным для башкирского, татарского и казахского языков. То есть Иманяй — «верующий», «человек веры». Такие имена давали с надеждой, что ребёнок вырастет богобоязненным и честным. Фамилия Иманяев, соответственно, означает «потомок Иманая».

Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с тюркским глаголом «иман» — «выздоравливать» или «исцеляться». В этом случае прозвище Иманяй могли дать ребёнку, родившемуся после долгой болезни, или человеку, который славился умением лечить. Однако эта гипотеза слабее, так как в антропонимике тюркских народов имя Иман в значении «вера» встречается значительно чаще, чем прозвища со значением «выздоровевший».

Географически фамилия Иманяев тяготеет к регионам, где исторически жили башкиры и татары: Башкортостан, Татарстан, Оренбургская и Челябинская области. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: вероятно, родоначальник был жителем конкретной деревни или аула, и его потомки долго не расселялись широко. Сословно предки Иманяевых скорее всего были государственными или ясачными крестьянами, реже — служилыми татарами. Дворянских родов с такой фамилией в российских родословных книгах не зафиксировано.

Фамилия сохранила в себе редкий для русского уха звуковой комплекс «им», что делает её легко узнаваемой и однозначно указывает на тюркские корни.