Фамилия Имартова — редкий случай, когда суффикс -ов- присоединился к основе, которая сама по себе уже звучит как фамилия. Перед нами не типичное «Имарт + ов», а скорее всего, форма родительного падежа женского рода от фамилии Имартов, закреплённая в документах. Такое иногда происходило в XIX веке при записи женщин в ревизские сказки или метрические книги: если главу семьи записывали как Имартов, то его жену или дочь могли механически внести как «Имартова», а позже эта форма закрепилась как самостоятельная фамилия для потомков по женской линии.

Основа фамилии — «Имарт» — выглядит иноязычной. Скорее всего, это не славянское прозвище, а адаптированное личное имя. Можно предположить две версии происхождения. Первая: от имени Эммануил или Иммануил (библейское «с нами Бог»), которое в просторечии могло сократиться до Имарт. Вторая: от кавказского или тюркского имени, например, Имарт или Имар — такие имена встречаются у осетин, чеченцев и ингушей, где «им» может означать «знак», «примета» или быть частью сложного имени. В пользу тюрко-кавказского следа говорит и то, что фамилии с основой на -арт нехарактерны для центральной России.

Географически фамилия Имартова почти не встречается за пределами Северного Кавказа и юга России. В архивах ЗАГС и базах данных XIX–XX веков носители сосредоточены в Ставропольском крае, Кабардино-Балкарии и Северной Осетии. Это косвенно подтверждает гипотезу о происхождении от местного имени.

Суффикс -ов- в данном случае указывает на принадлежность: «Имартова» — буквально «дочь или жена человека по имени Имарт». В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образуются от основ на -а/-я, форма на -ов здесь стандартна для мужского варианта, а женское окончание -а лишь грамматически оформляет род. Таким образом, фамилия Имартова — не женская версия мужской, а полноценный отапеллятив, где пол носителя заложен в окончании, но не в основе.

Встречается и вариант написания через двойное «м» — Иммартова, но это скорее описка или следствие влияния письменной формы имени Иммануил. Основной корпус документов фиксирует именно одно «м», что говорит о бытовом, устном происхождении фамилии, а не книжном.