Фамилия Ирмекеев — редкий случай, когда тюркское имя сохранилось в русской фамилии почти без изменений, пройдя лишь через минимальную русификацию. Её основа — личное имя Ирмекей, которое представляет собой диалектный вариант имени Ирмек или Ермек. В тюркских языках, особенно в башкирском и татарском, это имя восходит к слову «ир» (мужчина, герой) с уменьшительно-ласкательным аффиксом «-ек». Таким образом, Ирмекей — «мужчинка», «молодец», «удалец», но в ласковом, а не в грубом смысле. Встречается и версия, что корень связан с глаголом «ирмек» (достигать, догонять) — тогда имя означало бы «догоняющий», «успевающий», что тоже правдоподобно для прозвища.

Суффикс «-ев» в фамилии Ирмекеев — стандартный русский патронимический формант, который прикрепили к тюркской основе при оформлении фамилии в документах. Важно, что здесь не использовался более распространённый для тюркских имён суффикс «-ин» (как в фамилиях Ирмекин или Ермекин). Выбор «-ев» вместо «-ин» может указывать на то, что фамилию фиксировали в местности, где преобладала модель на «-ев» (например, в среде служилых татар или башкир, оформлявшихся через русскую администрацию в XVI–XVII веках). Сама фамилия — не мордовская и не марийская, как иногда ошибочно предполагают из-за созвучия с эрзянскими фамилиями на «-еев»; её тюркская основа очевидна.

Географически фамилия Ирмекеев почти наверняка привязана к Южному Уралу или Поволжью — к Башкортостану, Татарстану или Оренбургской области. Носители такой фамилии в прошлом были, скорее всего, башкирами или татарами, перешедшими в русское сословие (например, тептяри или государственные крестьяне). В дореволюционных метрических книгах эта фамилия встречается крайне редко, что подтверждает её локальный характер — она не разошлась широко, а осталась в пределах одного-двух родов. В советское время фамилия могла «затеряться» из-за смены паспортных данных или миграции, поэтому сегодня её обладателей немного.

Словообразовательная модель фамилии проста: корень «Ирмек-» + суффикс принадлежности «-ей» (в составе личного имени) + русский патронимический суффикс «-ев». Если бы фамилия образовалась напрямую от прозвища Ирмек (без промежуточного Ирмекей), она выглядела бы как Ирмеков. Вариант Ирмекеев — более старый, «документальный», сохранивший полную форму имени предка. Споров о происхождении корня почти нет: все исследователи сходятся на тюркской основе, разногласия лишь в том, считать ли исходное слово героическим («удалец») или описательным («догоняющий»). Первая версия кажется убедительнее: имена со значением «молодец» типичны для тюркской антропонимии, а «догоняющий» — слишком конкретное прозвище, которое редко становилось личным именем.