Фамилия Исбусынова — редкий пример, где на слух угадывается тюркская основа, а на письме — русский суффикс принадлежности. Вопреки ожиданиям, корень здесь не «Исбусын», а скорее «Исбусы» или «Исбус», к которому добавлен формант -ов. Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от мужских имён или прозвищ, и указывает на патроним: «чей?» — «Исбусынов», то есть потомок человека по имени или прозвищу Исбусы.

Основа «Исбусы», вероятнее всего, восходит к казахскому или другому тюркскому имени. Если разложить её на части, можно предположить «Ис» — как вариант «Ыс» или «Ис» (дым, запах, а в переносном смысле — слава, известность) и «бусы» — возможно, искажённое «бос» или «бус» (свободный, пустой, или же вариант «басы» — голова, начало). В тюркской ономастике сложные имена часто строятся из двух смысловых блоков: например, «Ысбосын» могло означать «пусть будет известным» или «пусть станет славой». Женское окончание -а в фамилии — результат адаптации к русской грамматике: мужская форма была бы Исбусынов, а женская — Исбусынова.

Географически фамилия тяготеет к Казахстану и приграничным регионам России, где сильно влияние тюркских языков. Маловероятно, что она имеет славянское происхождение: в старорусских документах подобных корней нет. Социальный контекст прост: предки носителей фамилии — кочевники или оседлые скотоводы, получившие фамилию при массовой паспортизации в XIX—XX веках, когда имена записывали на русский лад. Уникальность Исбусыновой в том, что она сохранила редкое имя-основу, почти не встречающееся в современных личных именах, и потому служит маркером конкретной родословной линии.