Фамилия Ишбирдина — женская форма, образованная от мужской Ишбирдин. Её основа восходит к составному тюркскому имени Ишбирды, которое переводят как «друг дал» или «товарищ дал». Слово «иш» в тюркских языках означает «друг, товарищ, спутник», а «бирды» — форма глагола «дать» (буквально «дал»). Такие имена-пожелания были распространены у башкир, татар и других тюркских народов: имя будто фиксировало событие — рождение ребёнка преподносилось как дар от друга или от самой судьбы.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ишбирдин — «сын или потомок Ишбирды». В русской среде фамилии на -ин получали из основ, оканчивающихся на -а/-я, что и произошло с тюркским именем Ишбирда (с конечной гласной, адаптированной под русское склонение). Встречаются варианты написания Ишбердин, что связано с диалектным произношением: в некоторых говорах «е» заменяет «и» в безударной позиции.

Географически фамилия привязана к Урало-Поволжью. Наибольшая концентрация носителей — в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречается и в среде сибирских татар. В дореволюционных метрических книгах запись фамилии могла варьироваться: Ишбирдинъ, Ишбердин, Ишбирдынов — последняя форма с русским патронимическим суффиксом -ов.

Сословный состав носителей был смешанным: среди предков Ишбирдиных встречались как тептяри и башкиры-вотчинники, так и государственные крестьяне. Отдельные ветви могли принадлежать к торговым людям — в уфимских купеческих списках XIX века попадаются однофамильцы.

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную тюркскую конструкцию имени-предложения, где действие (дарение) поставлено в центр. В русском ономастиконе таких фамилий немного — большинство тюркских основ дали фамилии на -ов, а здесь сработала модель на -ин, что делает Ишбирдину интересным примером языкового пограничья.