Фамилия Ишикян — армянского происхождения, и её разумнее всего рассматривать именно в этой языковой и культурной традиции, а не пытаться притянуть славянские или тюркские корни. Основа фамилии — «Ишик», что в переводе с армянского означает «свет» или «сияние». Это слово восходит к древнеармянскому «լույս» (луйс) через диалектные формы, где «ишик» — вариант, распространённый в западных говорах и у армян, долгое время живших в Османской империи.

Суффикс «-ян» — один из главных маркеров армянских фамилий. Он указывает на принадлежность к роду, происхождение от предка: буквально «из рода Ишика» или «относящийся к Ишику». Такой же суффикс мы видим в фамилиях Арамян, Петросян, Саркисян. Таким образом, Ишикян — это потомок человека, которого прозвали или назвали Светом. Вероятнее всего, речь идёт о прозвище: так могли назвать человека с особенно светлыми волосами или глазами, либо же того, кто нёс в себе некое внутреннее сияние — мудреца, наставника, священника.

В армянской ономастике встречается и другой вариант — фамилия Ишикян могла образоваться от личного имени Ишик, которое было неканоническим, но бытовало в народе. Имя с корнем «свет» — явление распространённое во многих культурах (вспомните славянское Светлана или тюркское Нур), и армянская традиция не исключение. В таком случае фамилия просто фиксирует родовое имя без дополнительной характеристики.

Географически носители фамилии Ишикян чаще всего встречаются среди западных армян — тех, чьи предки жили на территории исторической Западной Армении (сейчас восток Турции) и в Киликии. После геноцида 1915 года многие из них оказались в диаспоре — в Ливане, Сирии, Франции, США и Армении. В России фамилия тоже встречается, но сравнительно редко, и её носители — в основном потомки армянских переселенцев XIX–XX веков.

Интересная деталь: в русском языке фамилию Ишикян иногда склоняют по мужскому роду (Ишикяна, Ишикяну), а женский вариант остаётся неизменным — это общая черта для армянских фамилий, пришедших в русскую среду. В самой Армении фамилия не склоняется ни в мужском, ни в женском роде.