Фамилия Иссерс образована от еврейского имени Иссер, которое переводится как «борющийся с Богом» (по другой версии — «будет властвовать Бог»). Фактически Иссер является вариантом имени Израэль (в еврейском прочтении Йисраэль). Суффикс -с указывает на то, что фамилия сформировалась под литовским или латышским влиянием.

Имя Иссер — это не самостоятельное прозвище, а адаптированная форма, которая возникла в среде ашкеназских евреев Восточной Европы. В библейском имени Израэль (Йисраэль) первый слог «Йис» со временем упростился до «Исс», а окончание отпало или заменилось местным суффиксом. Таким образом, фамилия Иссерс — это не отчество в привычном русском понимании, а скорее патроним с балтийским окончанием, указывающим на принадлежность к роду человека по имени Иссер.

Географически фамилия тяготеет к Литве и Латвии, где суффикс -с (или -ис) был типичен для оформления фамилий в местных говорах идиша. В польских или украинских записях та же основа чаще превращалась бы в Иссерович или Иссерман. Встречается также написание Исерс, но вариант с двойной согласной «сс» более устойчив и лучше отражает исходное произношение.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Иссерс в XIX — начале XX века принадлежали к мещанскому или купеческому сословию, проживали в черте оседлости. Сведений о дворянском происхождении или принадлежности к известным раввинским династиям нет — фамилия бытовая, народная, без громких генеалогических линий.

Важно не путать Иссерс с близкой по звучанию, но другой по происхождению фамилией Иссерсон: последняя образована с помощью славянского патронимического суффикса -сон («сын Иссера»), тогда как Иссерс несёт на себе балтийский отпечаток. В современной России фамилия редкая, встречается в основном у потомков еврейских переселенцев из Прибалтики.