Фамилия Итпатси — редчайший случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели образования русских фамилий: нет суффиксов -ов, -ин, -ский, нет типичного окончания. Перед нами, скорее всего, не русская, а заимствованная фамилия, причем происхождение у нее экзотическое.

Самая вероятная версия — фамилия имеет финно-угорские корни, а именно карельские или вепсские. В карельском языке слово «itku» означает «плач», а «itkeä» — «плакать». Суффикс «-тси» (-tsi) в карельских фамилиях и прозвищах — распространенный уменьшительный или пренебрежительный формант. Таким образом, Итпатси могло быть прозвищем плаксивого ребенка или человека с печальным голосом. Дословно: «плакса», «тот, кто постоянно плачет». Подобные прозвища по поведению давали в деревнях очень часто, и они легко закреплялись за родом.

Вторая версия, менее правдоподобная, но возможная, — фамилия могла возникнуть на стыке культур, в среде крещёных саамов или коми. В коми языке есть слово «ит» — «след», «отпечаток». Тогда «итпатси» теоретически могло означать «идущий по следу», «следопыт». Однако фонетически карельская версия выглядит убедительнее, так как суффикс «-тси» для коми фамилий нетипичен.

Географически фамилия Итпатси почти наверняка привязана к регионам расселения карелов: Республика Карелия, Тверская область (где есть крупная карельская диаспора), а также Ленинградская и Вологодская области, граничащие с Карелией. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской среды северных губерний Российской империи, где фамилии у карелов начали массово закрепляться только в XIX — начале XX века, часто из прозвищ, которые давали в своей языковой среде.

Единичные случаи бытования фамилии в других регионах России — результат миграций XX века. Из-за редкости и нестандартного звучания фамилия Итпатси нередко подвергалась искажению при записи в паспорта и метрики, но сохранила свой уникальный облик.