Фамилия Иуан — редкая, почти штучная, и её происхождение напрямую связано с церковным именем, которое в русском языке претерпело необычную трансформацию. В основе лежит каноническое имя Иоанн (Иван). Но если стандартная фамилия Иванов образована от обиходной, народной формы «Иван», то Иуан — это результат книжного, церковнославянского произношения или же следствие искажения имени при записи.

В древнерусской письменности имя Иоанн часто писали сокращённо — под титлом. При чтении вслух в церковной среде его могли произносить как «Иуан» (в некоторых диалектах или при быстром чтении «Ио» переходило в «Иу»). Фамилия могла закрепиться за потомками человека, которого в документах или в быту звали именно так — Иуан, то есть Иван. Это не просто вариация, а указание на то, что предок был грамотным книжником, священнослужителем или состоял при церкви, где имя записывали по-славянски, а не по-народному.

Словообразовательная модель проста: к основе Иуан добавился нулевой суффикс (фамилия осталась в чистой форме, без типичных русских -ов, -ин). Это нетипично для русских фамилий крестьянского или мещанского сословия. Чаще всего такие «голые» фамилии (без суффикса) встречаются у выходцев из духовенства или у украинцев и белорусов, где подобная модель распространена шире. Возможно, фамилия Иуан — это украинизированная или белорусская форма, пришедшая из западных губерний Российской империи, где имя «Іуан» (с ятем) фиксировалось в метриках.

Географически фамилия крайне редка. Скорее всего, она бытовала в среде потомков сельских священников или псаломщиков, которые получали фамилию по имени отца, но без переделки в стандартный патроним. Другая, менее вероятная версия — фамилия могла возникнуть из прозвища, данного человеку за набожность или за то, что он «по-писаному», чванливо произносил своё имя как Иуан, а не Иван. Но первая версия — от церковной записи — выглядит убедительнее, так как опирается на реальную практику делопроизводства в синодальный период.