Фамилия Качюшите — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано с литовским языком. Окончание «-ите» (или «-ите» в русской передаче) — это типичный литовский суффикс, образующий женские фамилии от мужских основ. В Литве фамилии жён и дочерей часто отличаются по окончанию: мужская форма звучала бы как Качюлис или Качюнас. Таким образом, Качюшите — это «дочь Качюлиса» или «жена Качюлиса», то есть фамилия по отцу или мужу.

Основа «Кач-» восходит к литовскому слову «kakti» или «kakšti», что означает «хватать», «доставать», «карабкаться» или «пробираться». Отсюда прозвище «Качюлис» могло закрепиться за человеком ловким, цепким, умеющим выкрутиться из сложной ситуации, или за тем, кто постоянно куда-то лезет — в прямом смысле, например, за сборщиком ягод или охотником, пробирающимся через чащу. Встречается и более прозаичная версия: «kakšti» в некоторых говорах означало «чесать», «скрести», и прозвище могло относиться к человеку с привычкой чесаться или к тому, кто занимался грубой работой, например, скреблом.

Географически фамилия Качюшите почти наверняка происходит из Литвы или из исторических районов с сильным литовским влиянием (Занеманье, Виленщина, частично Беларусь). В русский контекст она попала, скорее всего, в советское время, когда литовские фамилии записывали по-русски с сохранением окончания. Носительница такой фамилии — женщина, и предки по мужской линии, вероятно, были крестьянами, ремесленниками или мелкими землевладельцами из литовских или смешанных польско-литовских семей.

В отличие от многих русских фамилий на -ов/-ин, Качюшите не указывает на принадлежность к конкретному сословию или ремеслу, а скорее маркирует национальное и языковое происхождение. Это фамилия-памятник балтской антропонимической традиции, где родство выражалось не отчеством, а окончанием фамилии.