Фамилия Калинайте — редкий для России пример фамилии литовского происхождения, застывшей в женской форме. В русском языке она почти не встречается, и если вы носите её в России или Украине, то, скорее всего, ваши предки происходят из Литвы или из приграничных районов Беларуси, где сильно литовское влияние.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа «Калин-» и литовский женский суффикс «-айте» (-aitė). В литовской ономастике суффикс -aitė традиционно обозначал незамужнюю дочь, то есть буквально «Калинайте» — это «дочь Калинаса». Мужской вариант фамилии звучал бы как Калинас (Kalinas) или, реже, Калинавичюс. Такая модель характерна для литовских крестьянских фамилий, которые массово закрепились в XIX веке после отмены крепостного права.

Основа «Калин-» восходит к литовскому слову «kalnas» — гора, холм. Таким образом, прозвище Калинас мог получить человек, живший на возвышенности, у холма, или выходец из гористой местности. Вторая версия, менее вероятная, — связь с балтийским корнем «kal-» (бить, ковать), но для фамилий такая семантика встречается реже. В любом случае, связь с русским словом «калина» здесь случайна: это омонимия, а не родство.

В дореволюционной России фамилия Калинайте могла писаться с ошибками: Калинайт, Калинайте, а в метрических книгах её могли русифицировать, добавляя окончание -а (Калинайта) или переделывая в Калинин. В советское время, при паспортизации, многие литовские фамилии теряли национальный суффикс, поэтому вариант Калинайте — признак сохранения исходной литовской формы, что встречается нечасто.

Если вы ищете корни, стоит обратить внимание на уезды бывшей Ковенской губернии и на юг Литвы — именно там фамилии на -айте наиболее распространены. Носителей этой фамилии в мире немного, и она почти не выходит за пределы балтийского ареала.