Фамилия Кальсанова — редкий случай, когда географический маркер почти наверняка перевешивает все остальные версии происхождения. Её основа — топоним Кальсан, искать который нужно не в средней полосе России, а на Кавказе. В первую очередь — это осетинское село Кальсан (Къалсан) в Дигорском ущелье Северной Осетии. Фамилии, образованные от названий аулов и сёл, — характерная черта осетинской антропонимии: человека называли по месту, откуда он родом, а его потомки закрепляли это прозвище как родовое имя.

Суффикс -ов(а) указывает на русскую или обрусевшую форму, в которую переоформили осетинскую фамилию при записи в метрики или советские документы. В самой Осетии аналогичная фамилия звучала бы как Калсановы или Кальсанты (по осетинской модели множественного числа). Таким образом, Кальсанова — это «та, что из Кальсана». Носительницы фамилии, скорее всего, имеют осетинские корни, возможно, дигорские, так как Дигория — историческая область расселения дигорцев.

Есть и менее вероятная, но возможная версия — связь с фамилией Кальсанов, которая могла возникнуть в среде русских крестьян или духовенства от прозвища Кальсан. В этом случае корень восходит к диалектному глаголу «кальсать» (или «калсать») — в некоторых северных говорах это означало «пачкать, марать», «делать небрежно». Прозвище могли дать неряшливому человеку или плохому работнику. Однако массового распространения у такой модели нет, и на фоне чёткой осетинской топонимики эта гипотеза выглядит слабой.

Встречаемость фамилии в России невысока и сосредоточена в основном на Северном Кавказе, особенно в Северной Осетии, а также в регионах, куда осетины мигрировали в XX веке. В отличие от фамилий на -ов, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Кальсанова несёт в себе не личную характеристику предка, а его «малую родину» — конкретное ущелье и село.