Фамилия Кандрахина — женская форма, мужской вариант — Кандрахин. Её основа — редкое в современном русском языке имя или прозвище Кандраха. Чаще всего это производная форма от крестильного имени Кондратий (лат. Condratus, от condire — «устраивать, улаживать»). В русской народной традиции Кондратий легко превращался в Кондрата, а от него — в Кандрата, Кандраху. Суффикс -аха типичен для обиходных, «домашних» имён (Миха, Гришаха, Федяха). Таким образом, Кандраха — это тот же Кондрат, но в ласково-упрощённой форме.

Модель образования фамилии — классическая «окончание -ин». Фамилии на -ин в русском языке образуются от основ, оканчивающихся на -а, -я (Кандрах-а → Кандрах-ин). Это указывает на принадлежность: «чей?» — Кандрахин, то есть сын или потомок человека по имени Кандраха. Такие фамилии были распространены в северных и центральных губерниях России, где -ин встречается чаще, чем -ов.

Интересная деталь: фамилия Кандрахин сохранила древнюю черту — чередование согласных в корне (Кондратий — Кандраха). Это не ошибка, а живой диалектный процесс, при котором безударный «о» переходил в «а» (аканье), а «т» перед суффиксом -аха заменялось на «х». Подобные варианты встречаются у фамилий Кондрахин, Кондратьев, Кандратьев — все они восходят к одному имени, но разошлись по разным говорам.

В дореволюционных документах фамилия могла записываться через «о» — Кондрахина, но написание с «а» (Кандрахина) закрепилось в тех семьях, где аканье было нормой. Сословной привязки у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и мещане, и духовенство, поскольку имя Кондратий было популярно во всех слоях общества.

Если искать однокоренные фамилии, то ближайшие — Кондрахин, Кондратов, Кандратов. Все они ведут родословную к одному предку, которого в быту звали Кандрахой или Кондрахой.