Фамилия Канзипаров — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она образована от прозвища или имени, которое в русском языке не встречается, а значит, корни нужно искать в тюркских или арабских языках. Основа «Канзипар» почти наверняка составная. Первая часть, «Канзи», может восходить к арабскому «канз» (сокровище, клад) или к тюркскому «кан» (кровь, родня). Вторая часть, «пар», часто означает «имеющий» или является частью сложных имён (как, например, в имени Джафар). Таким образом, Канзипар могло означать «обладающий сокровищем» или «имеющий знатное происхождение».

Суффикс «-ов» указывает на русскую модель образования фамилии: её дали потомкам человека по имени или прозвищу Канзипар. Скорее всего, это была не случайная кличка, а осмысленное имя, данное при рождении. В среде татар, башкир или других тюркских народов, исповедующих ислам, такие составные имена были распространены. Фамилия закрепилась, когда предок Канзипаровых перешёл на русскую службу или попал в перепись, где его записали по отцу: «Канзипаров сын».

Географически фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Урала — традиционным местам расселения татар и башкир. Встречаются Канзипаровы и у казахов, что подтверждает тюркскую основу. В русских говорах слово «канзипар» не зафиксировано, поэтому версия о чисто славянском происхождении отпадает почти наверняка.

Интересна вариативность написания. В старых документах фамилию могли записать как Канзыпаров или Конзипаров — это следствие того, что безударные гласные в тюркских словах на слух воспринимались по-разному. Единого написания до паспортизации XX века не существовало, поэтому у разных ветвей одного рода могли закрепиться разные варианты.

Сословно Канзипаровы, скорее всего, были из служилых татар или государственных крестьян. Дворянство среди носителей фамилии не отмечено, а значит, предки либо несли военную или ямскую службу, либо занимались земледелием и ремёслами.