Фамилия Капочюте звучит для русского уха непривычно, и это неслучайно: её основа — литовская. Это женская форма фамилии, образованная по литовской модели с суффиксом -юте (-iūtė), который указывает на незамужнюю женщину, дочь. Мужской вариант в таком случае — Капочюс (Kapočius). Если вы встретили Капочюте, то знайте: перед вами, скорее всего, женщина из Литвы или из литовской диаспоры, а её отец или родоначальник мужского пола носил или носит фамилию Капочюс.

Сама основа «Капоч-» (Kapoč-) ведёт к литовскому слову «kapoti» — «рубить, сечь, крошить». Вряд ли это прямое указание на профессию дровосека или мясника. В литовской антропонимии такие глагольные основы часто превращались в прозвища по характеру или манере поведения: «рубака», «резкий человек», «тот, кто режет правду-матку». Возможна и более прозаичная версия: прозвище могли дать человеку, который работал с рубящими инструментами — косой, топором, сечкой. Но в любом случае, корень — бытовой и конкретный, без мистического подтекста.

Фамилия эта — относительно редкая даже в Литве. В России и других славянских странах она встречается эпизодически, в основном среди потомков литовцев, переселившихся в XIX–XX веках (например, в Калининградскую область или в Сибирь после реформ Столыпина). Обратите внимание на окончание: в русских документах фамилию могли искажать, записывая как «Капочюте» без ударения, хотя по-литовски ударение падает на первый слог: Ка́почюте. Если вы носитель этой фамилии, то, скорее всего, ваши предки — из исторической Литвы (Жемайтия или Аукштайтия), и фамилия сохранилась в женской форме, что само по себе редкость для русскоязычной среды, где фамилии обычно не меняются по полу.