Фамилия Капсенкова — женская форма фамилии Капсенков. Её основа, скорее всего, связана с древнерусским или диалектным словом «капсень» или «капсюк». В словарях XIX века фиксируется слово «капсень» в значении «капюшон», «мешок», а также «скупой, скряга». Отсюда прозвище Капсенок — человек, который либо носил характерную одежду с капюшоном, либо отличался скупостью. Второе значение встречается в псковских и тверских говорах, что даёт региональную привязку: предки носителей фамилии могли жить на северо-западе России.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов-/-ев- присоединялся к прозвищу на -ок (Капсенок → Капсенков). Ударение в фамилии, вероятно, падает на второй слог: Капсе́нкова, хотя в народной речи возможны варианты. Более редкая версия — происхождение от имени Капсень, которое могло быть уменьшительной формой от крестильного имени Капитон или Кассиан, но это менее вероятно, так как «капсень» — хорошо задокументированное нарицательное слово.

Встречаемость фамилии невысокая, основная масса носителей сосредоточена в центральных и северо-западных областях России, особенно в Тверской и Псковской губерниях по данным переписей конца XIX — начала XX века. Встречаются также варианты написания с одной «с» — Капенков, что может указывать на разное диалектное произношение.

Таким образом, фамилия Капсенкова — это «фамилия-прозвище», указывающая на характерную черту внешности или поведения предка.