Фамилия Карамакова — женская форма от Карамаков, и ключ к её происхождению лежит в основе «карамак». Это слово почти не встречается в современных словарях, но в диалектах и тюркских языках оно оставило след. Самая прямая версия: «карамак» — это тюркское прозвище или имя, образованное от «кара» (чёрный) и «мак» (пятно, знак). В татарском, башкирском и казахском языках «карамак» может означать «чёрное пятно», «родинка» или «тёмная отметина». Прозвище Карамак давали человеку с заметной родинкой, смуглой кожей или тёмными волосами — по внешнему признаку, который бросался в глаза. В русской среде такое прозвище закрепилось как фамилия через суффикс -ов, типичный для образования от прозвищ и имён.

Есть и другая, менее очевидная гипотеза: «карамак» может быть искажением от «караман» — тюркского имени со значением «чёрный, стойкий» или «защитник». Но для фамилии Карамаков форма на -ак встречается реже, чем на -ан, поэтому версия с «пятном» выглядит убедительнее. Встречается фамилия в основном в Поволжье и на Урале — в регионах, где веками жили рядом русские и тюркские народы. Предки Карамаковых могли быть крестьянами или казаками, получившими прозвище от соседей-татар или башкир. Слово «карамак» в некоторых говорах также означало «черномазый» — ещё один намёк на внешность.

Сравните с однокоренными фамилиями: Караманов (от «караман»), Карамаев (от «карамай» — «чёрный жир»), Карамазов (знаменитая литературная фамилия, образованная от тюркского «карамаз» — «чёрный глаз»). Карамаков стоит особняком — его основа короче и конкретнее, без лишних суффиксов. Если ваш предок носил прозвище Карамак, он, скорее всего, жил в смешанной этнической среде, где тюркские слова легко входили в русский быт. Фамилия редкая, и в документах XVII–XIX веков её носители могли быть записаны как Карамаковы, Карамаковы или даже Карамакавы — из-за местных особенностей произношения.