Фамилия Караышева (мужской вариант — Караышев) — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа — «караыш» — не встречается в современных словарях, поэтому разбирать её приходится через тюркские корни, что сразу указывает на географию происхождения: скорее всего, Поволжье, Урал, Сибирь или регионы, где русские фамилии складывались у крещёных татар, башкир, чувашей или казахов.

Ключ к пониманию — слово «кара» (тюрк. «чёрный», «тёмный») и «ыш» (или «иш» — «товарищ», «спутник», «пара»). В тюркских языках «кара» часто входит в состав личных имён-оберегов (Карабай, Карагул) или прозвищ, а «ыш» может означать «дело», «работа» (ср. тат. «эш»). Однако правдоподобнее другая версия: «кара» + «ыш» (от «иш» — «одинаковый», «ровный») дают значение «чёрный ровня» или «тёмный товарищ» — так могли прозвать человека за смуглую внешность или в качестве охранительного имени, чтобы отвести сглаз. Встречается и вариант, что «караыш» — это искажённое тюркское «карауыл» (караул, стража), но для фамилии Караышева это менее вероятно из-за разницы в суффиксе.

Суффикс «-ев» (а не «-ов») указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или шипящий — в данном случае на «ш». Модель образования типична: прозвище Караыш → Караышев — «сын (или потомок) Караыша». Фамилия могла закрепиться в среде служилых татар или крестьян, но без сословных списков точнее сказать нельзя. Встречается она крайне редко, даже в базах данных переписей XIX века её почти нет, что говорит о локальном бытовании — возможно, в одном-двух селениях.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Карашев (от «караш» — «взгляд») встречается чаще, но Караышев стоит особняком: двойная гласная «ы» после «р» — нетипичный для русского уха звуковой ряд, который прямо выдаёт тюркский оригинал. Носителям фамилии стоит искать корни в документах Оренбургской, Уфимской или Казанской губерний — там, где тюркские прозвища переходили в русские фамилии без сильной русификации.