Фамилия Касуканова женская, а её мужская форма — Касуканов. В основе фамилии лежит тюркское или кавказское мужское личное имя Касукан. Это сложное имя, состоящее из двух частей: «касу» и уменьшительно-ласкательного аффикса «-кан». Первая часть восходит к арабскому имени Касим (Qāsim — «распределяющий», «разделяющий») или к тюркскому слову «касу» в значении «ровесник», «сверстник». Вторая часть — типичный для тюркских языков суффикс, образующий ласкательные формы имён (сравните: Ахмет — Ахметкан, Умар — Умаркан).

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов/-ев, что характерно для фамилий, возникших в среде крещёных народов Поволжья, Кавказа или Средней Азии. Когда представители тюркских или горских народов принимали православие, их патронимы (отчества) русифицировались: «сын Касукана» превращалось в «Касуканов». Суффикс -ов здесь — не указание на принадлежность, а стандартный способ адаптации иноязычного имени к русской фамильной системе.

Географически фамилия Касукановы встречается в основном среди кабардинцев, балкарцев, кумыков и других народов Северного Кавказа, а также у татар. В русских переписных книгах она почти не фиксируется, что подтверждает её позднее вхождение в общероссийский именослов. Предки носителей фамилии, скорее всего, были свободными общинниками или узденями (дворянами в горском обществе), а имя Касукан давалось мальчику либо в честь деда, либо как пожелание стать «ровней» другим уважаемым людям.

Интересная деталь: в осетинском языке слово «касу» означает «наблюдатель», «сторож», а в тюркских диалектах — «ровный», «одинаковый». Если фамилия имеет осетинские корни, её основа могла быть прозвищем бдительного человека. Однако версия с арабским именем Касим надёжнее: она объясняет и распространённость корня, и типичную для исламского мира традицию называть детей в честь пророков и сподвижников.