Фамилия Кайраканова — женская форма фамилии Кайраканов. Её основа — прозвище или тюркское личное имя Кайракан. Наиболее вероятная версия связывает его с тюркским словом «кайрак» — точильный камень, оселок. В переносном смысле так могли назвать человека с твёрдым, неуступчивым характером, либо того, кто занимался заточкой инструментов — ремесленника, кузнеца или мастера по изготовлению ножей.

Вторая, менее распространённая гипотеза, выводит имя из двух тюркских основ: «кай» (судьба, рок) и «ракан» (дракон). В этом случае имя могло быть оберегом — чтобы отпугнуть злые силы или, наоборот, дать ребёнку силу мифического существа. Однако такая трактовка встречается реже и требует дополнительных диалектных подтверждений.

Фамилия образована по русской патронимической модели с суффиксом -ов. Это говорит о том, что предок носителя фамилии жил в зоне контакта русских и тюркских народов — вероятно, в Поволжье, на Урале, в Сибири или в казахских степях, где подобные имена и прозвища входили в русскую делопроизводственную традицию. Суффикс -анов вместо -ов в данном случае — результат адаптации тюркского окончания имени: Кайракан + ов.

Фамилия редкая, в списках массовых русских фамилий не встречается. Её носители, скорее всего, происходят из смешанной тюрко-славянской среды, где имя или прозвище отца (Кайракан) было записано в документах и передано детям как наследственное. Сословная принадлежность могла быть любой: от казаков и крестьян до служилых людей, но точных данных по этому роду нет.