Фамилия Кажыркан — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно славянскими корнями. Чтобы понять её значение, нужно отбросить привычную модель «Иван — Иванов» и обратиться к тюркским языкам. Основа фамилии — «кажыр» (или «казыр»), что в ряде тюркских наречий (особенно в казахском и киргизском) означает «суровый», «строгий», «грозный». Это не описание внешности, а скорее характеристика нрава или даже прозвище воина, обладающего крутым и непреклонным характером. Второй компонент «-кан» — это распространённый в тюркской антропонимии формант, означающий «хан» или «владыка», но в составе личных имён он часто выступает как усилительная частица, придающая имени оттенок величия или полноты качества. Таким образом, Кажыркан — это двусоставное тюркское личное имя, которое можно перевести как «Суровый хан» или «Грозный властелин».

Как это имя превратилось в русскую фамилию? Вероятнее всего, в XIX — начале XX века, когда шёл активный процесс русификации имён народов Российской империи. Носитель имени Кажыркан (например, казах, киргиз или башкир) был записан в метрическую книгу или ревизскую сказку просто по имени, которое и стало его фамилией. В русской традиции фамилии на -ов, -ев или -ин здесь нет — это так называемая «застывшая» форма имени, которая не менялась по падежам как прилагательное. Такие фамилии характерны для южно-сибирского и урало-поволжского регионов, где был силён тюркский субстрат.

Спорным моментом могла бы стать версия о происхождении от русского слова «кожура» или «кажыр» как искажённого «кашевар», но она разбивается о фонетику: в русских говорах не было мягкого «ж» в начале слова, и подобные прозвища образовывались бы с суффиксами (Кажурин, Каширин). Единственная правдоподобная версия — тюркская. Если искать однокоренные фамилии, то это Кадыров (от «кадыр» — могучий) или Касымов (от «касым» — строгий, распределяющий), — но Кажыркан стоит особняком, сохранив полную форму имени без усечения.

Социальный контекст: предки носителя фамилии Кажыркан, скорее всего, были кочевниками-скотоводами, воинами или старейшинами рода. Само имя-прозвище говорит о том, что в родной среде человека уважали или побаивались за его твёрдость. Встречается фамилия крайне редко, в основном в южных регионах Казахстана и в приграничных с ним областях России (Оренбургская, Астраханская), что подтверждает её локальный характер. В русском языке фамилия не склоняется, если принадлежит мужчине, и остаётся неизменной для женщины.